[Sirin]

Разница в том, что в первом случае если этому "лицу" предъявить будет нечего, то у него будет право на реабилитацию

В данном случае, полагаю, по столь резонансному делу право на реабилитацию никого особо не парит.
Парит другое:
- если дело возбуждено "в отношении", и через годик в действиях конкретного лица состава так и не найдут, - дело спокойненько закроют и забудут;
- если "по факту", то мало ли, что в действиях конкретного лица нет состава - факт - то налицо! - не можешь посадить Ляпкина, подавай Тяпкина!
А к тому времени буря в чиновничей братии уляжется, и "своих" снова сажать нельзя будет.